肛门黏膜由单层柱状上皮组成,而阴道黏膜由复层柱状上皮组成,也就是说肛门黏膜比阴道黏膜娇嫩得多,故肛交时阴茎和肛门黏膜剧烈而频繁地摩擦,极易造成损伤,从而使精液及前列腺液中的艾滋病病毒通过损伤处进入被插入者的血液,因此肛交被看作是艾滋病病毒感染最高危的性活动。同阴茎-阴道性交和阴茎-口腔性交相比,接受的一方性伴侣具有感染艾滋病病毒更大的危险性。