《新世纪全国高等中医药院校规划教材:方剂学(第2版)》分为上、下两篇。上篇总论重点介绍方剂学发展简史、方剂与治法,以及方剂分类、组成和配伍、剂型、用法的基本知识；下篇各论主要根据治法、功用,将方剂分为解表、泻下、和解、清热、温里、补益等19类,选入基础方、代表方以及临床常用方共362首,其中正方182首,附方180首。最后还附有“方剂歌诀”和“方名索引”。

每类（章）方剂分为概说、正方、小结、复习思考题四个部分、概说的内容包括每类方剂的定义、治法、功用、适应范围、使用注意,以及每节方剂的适应证、临床特点、常用药物、配伍方法、代表方等。正方内容有方名与出处、组成、用法、功用、主治、方解、运用、附方、文献摘要、临床报道、实验研究等项。小结内容是将每类方剂提纲挈领地予以综合、对比,分述类方的异同。复习思考题是根据每章方剂必须重点掌握的内容,以培养学生独立思考、综合分析的能力。