《明清史学术文库：明代南京寺院研究》作者运用了历史学、宗教学、政治学、经济学、文化学、社会学、教育学、文学、哲学以及建筑学等多学科、多角度的研究,对明代南京寺院的背景、兴废和分布、僧人来源与等级结构、佛学水平与儒学修养、寺院经济与制度、寺院建筑以及寺院对明代政治、经济、文化、民众生活等的作用和影响进行了全面、系统、深入、综合的考察,细致入微,新意迭出,令人信服。本文引用了大量文献资料,如正史、实录、地方志、寺院志、历朝高僧传、古人文集,旁及野史、小说等,以及近人考古发掘资料,计二百余种。对《明实录》、《金陵梵刹志》、《栖霞小志》、《牛首山志》、《献花岩志》、《摄山志》、《大明高僧传》、《补续高僧传》、《新续高僧传》等用力最勤,曾反复研读,还几次到南京各寺院进行实地访问和考察。在此基础上,分析考辨,去粗取精,使本文内容更加丰富翔实,立论更加坚实可信。足见作者的功力深厚和踏实。本文在指出南京佛寺对社会的消极影响外,也公允地、实事求是地提出其另一方面的作用。如,佛寺兴建虽耗费大量资财,却增加了下层劳动人民的就业机会；佛教虽有麻痹人民斗志的一面,但稳定了社会秩序,对社会生产发展和人民生活也有一定积极效应：对藏传佛教的重视,对西藏僧人上层的封授,实现了对西藏的管理,一些藏僧到南京受封、讲道、交流教义,对加强民族团结、维护国家的统一也有一定作用等。有些评论者指出,这对我们今天制定民族政策和宗教政策也有现实借鉴意义。